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我国农业科研实力最为雄厚的农业、水产、热作三家国家级研究院将面临重大的科研体制改革，所属６６个研究所将分别转为非营利研究所、转制为科技型企业、转为农业事业单位或进入大学，科技力量和科技资源重新进行布局和配置。
农业部部长杜青林说，农业科研机构管理体制改革对于增强科研机构的生机与活力，提升我国农业的科技竞争力，具有重要的意义。农业科研机构此次重大改革重点解决科研结构不够合理、科技与经济结合不够紧密、运行机制不适应等问题。通过改革将农业部部属农业科研机构真正建成为农业科技创新的国家队，农业先进技术推广的重要力量，农业科技产业化的生力军，在农业结构战略性调整、提高农业国际竞争力和增加农民收入等方面发挥重要作用。
今年１０月，科技部、财政部、中编办三部门正式批复了农业部科研机构改革方案，作为国务院部门属第二批公益类科研机构启动改革。改革保留中国农业科学院、中国水产科学院、中国热作科学院原有建制和领导管理体制，对所属研究所进行分类改革。按照非营利性科研机构管理的研究所２９个，转制为科技型企业的研究所２２个、转为农业事业单位１１个、进入大学４个。改革后，拟定非营利性科研机构编制４４２７人，占在职职工总数的２９．７％。
据介绍，非营利性科研机构以应用基础研究为主，突出国家农业科技创新意志，重点解决国家全局性、关键性、方向性、基础性的重大农业科技问题。转制为科技型企业的研究所按照现代企业制度要求，从事有特色的技术创新与高新技术的产业化。通过企业化运作，以资产为纽带，组建农业、水产、热作集团公司或股份公司，形成农业科技产业化龙头企业，促进农业增效和农民增收。转为农业事业单位的研究所，将重新确定智能定位、服务领域和发展方向，进入大学的研究所要与大学的人力资源和学科综合优势相结合，优势互补共同发展。
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